Die Giemsas Azur Eosin-Methylenblau Lösung wird für die Färbung von Blut- und Knochenmarkausstrichen, Paraffinschnitten und klinisch-zytologischem Material verwendet. Die Giemsas Färbung ist eine in der Histologie standardmäßig verwendete Methode und stellt die verschiedenen Zellen mit ihren morphologischen Merkmalen besser differenziert dar als die H&E Färbung. Auch für den Nachweis von Helicobacter pylori in Magenbiopsien kann mit der Giemsa Färbung gefärbt werden. Im gefärbten Zellmaterial erscheinen die Zellkerne in verschiedenen Blautönen und andere Bestandteile werden in unterschiedlichen Rottönen dargestellt.